施奈德回到家乡后，亲如兄弟的四只忍者神龟不再像以前那样并肩作战，因为他们没有敌人了。 相反，他们各自在自己喜欢的领域学习。 曾经一起行动的忍者神龟变成了四位孤独的“独行侠”！ 这时，纽约市发生了一系列奇怪的事情。 原来，实业家马克西米利安·J·维特斯意图征服纽约市，并神奇地培养了一支由牵强附会的野兽组成的军队。 加上臭名昭著的忍者组织脚族，各种黑暗势力遍布在城市的各个角落。 准备好移动了！ 海龟们再次做好了战争的准备！ 他们再次团结起来，准备反击黑暗力量！
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